Kepengurusan PCINU Jerman terdiri dari tiga dewan dengan fungsinya masing-masing,

1. Dewan Syuriah (badan musyawarah)

• Menentukan arah kebijakan organisasi dalam melakukan usaha dan tindakan untuk mencapai tujuan
• Memberikan petunjuk, bimbingan dan pembinaan pemahaman, pengamalan dan pengembangan ajaran Islam berdasar paham Ahlussunah wal Jamaah
• Mengendalikan, mengawasi dan memberikan koreksi sesuai ketentuan organisasi
• Membatalkan keputusan lembaga

 

• • Rais Syuriah: K.H. Syaeful fatah
  • Wakil Syuriah: Habib Husein Al Kaf
  • Katib Syuriah: Zacky Khairul Umam
  • Wakil Katib Syuriah: Prof. Hendro Wicaksono

 

2. Dewan Mustasyar (badan penasihat)

• Memberikan nasehat kepada pengurus baik diminta atau tidak

 

• • KH. Thobary Syadzily
  • Trigerya Vembra Vidjaja
  • Yoktri Handoyo
  • Bram Fernandin
  • Abdul Muin
  • Yudi Ardianto

 

3. Dewan Tanfidziyah (badan pelaksana harian)

• Memimpin jalannya organisasi sesuai dengan kebijakan dewan syuriah
• Melaksanakan program-program harian PCINU Jerman
• Membina dan mengawasi kegiatan yang dilakukan perangkat dibawahnya
• Menyampaikan laporan secara periodik tentang pelaksanaan tugasnya.

 

• • Ketua Tanfidziyah: Muhammad Rodlin Billah
  • Wakil Tanfidziyah Bidang Keorganisasian: Rina Agustina
  • Wakil Tanfidziyah Bidang Kerjasama: Miftah El Azmi
  • Wakil Tanfidziyah Bidang Kelembagaan: Muhammad Ar Rayyaan

 

• • Sekretaris Jendral: Royyan Rijal Ramadhan
  • Wakil Sekretaris Jendral: Mirza Ilham 
  • Bendahara Umum: Royyan Mas
  • Wakil Bendahara I: Yulia
  • Wakil Bendahara II: Aziza